Villanos

Dio Brando

Dio Brando llamado simplemente DIO a partir de la Parte 3 en adelante, es el antagonista principal de la Parte 1: Phantom Blood y la Parte 3: Stardust Crusaders. También es un personaje póstumo en Stone Ocean siendo el responsable del ascenso de Enrico Pucci a la villanía.

Originalmente de nacimiento un hombre de bajos recursos, pero de ambición incomparable, Dio es un villano de poca conciencia, gran astucia, y un hambre insaciable de poder. Es el padre de Giorno Giovanna, el protagonista de la Parte 5: Vento Aureo, así como unos cuantos otros hijos ilegítimos. Como antagonista dominante de JoJo's Bizarre Adventure, su legado persiste a lo largo de la historia.

Kars 

Es el antagonista principal de la Parte 2: Battle Tendency.

Es el diseñador de la Mascara de Piedra, y el líder con 102.000 años de antigüedad de los Hombres del Pilar restantes. Su objetivo es evolucionar todavía más lejos para ser inmune a los rayos del sol, y esa razón él busca la Piedra roja de Aja para energizar sus máscaras, luchando contra los usuarios de Hamon para su posesión

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Yoshikage Kira

Es el antagonista principal de Diamond is Unbreakable.

Es un asesino en serie comprometido a defender su ininterrumpido estilo de vida.

Diavolo

Es el antagonista principal de Vento Aureo. También es el padre de la joven Trish Una. Como el líder de Passione, Diavolo supervisa una influencia perniciosa sobre la población napolitana. Al mismo tiempo es un hombre obsesionado con evitar que la gente sepa quien es realmente, desarrolla un trastorno de personalidad múltiple, dando origen a una segunda personalidad. Busca a Trish no para reencontrarse con ella sino para matarla ya que ella es una pista potencial que le permitiría a sus enemigos conducirlos a él.

Vinegar Doppio

Es el más joven, más inocente y excéntrico sottocapo de Diavolo. Como miembro de Passione, se considera a sí mismo como el subordinado más fiel a Diavolo cuando en realidad, son la misma persona.

Enrico Pucci

Es el antagonista principal de Stone Ocean.

Trabajando como un sacerdote en la Prision Green Dolphin Street, aspira a implementar un plan formulado hace mucho tiempo por DIO para alcanzar el paraíso.

Funny Valentine

Es el antagonista principal de Steel Ball Run.

Habiendo encontrando el Corazón del Cadaver durante su servicio en la Guerra de Secesión, Valentine pasa a ser el 23ro presidente de los Estados Unidos.